תוֹכֶן
גופתו של הצפרדע מורכבת מראש, צוואר ותא מטען. המוח, הפה, העיניים, האוזניים והאף כלולים בחלק השטוח בדרך כלל של ראש החיה. בניגוד לבני אדם אשר איבריהם הפנימיים ממוקמים בחזה, בבטן ובאגן, לב הצפרדע, הריאות ואברי העיכול נמצאים כולם בתוך תא המטען, בתוך חלל אחד, המכונה "סלואם".
מוֹחַ
מערכת העצבים של הצפרדע, המורכבת ממוחו, חוט השדרה ועצביו, מפותחת מאוד. מספר גדול של חלקים חשובים במוח הצפרדע תואמים לחלקים דומים במוח האנושי. אלה כוללים את חוט השדרה המווסת את הנשימה ואת העיכול ואת המוח המסדיר את תיאום השרירים ואת תנוחת הגוף. בהשוואה לבני אדם, מוחו של צפרדע הוא פרופורציונלי מאוד קטן.
לֵב
לב הצפרדע מורכב משני חדרים עליונים, הנקראים אטריום ימני ושמאלי ותא תחתון יחיד, הנקרא חדר. כיסוי המגן, הנקרא קרום הלב, מקיף את הלב. גם דם עורקי וגם דם ורידי, המכיל גזי פסולת, נמצאים כל הזמן בחדר הצפרדע. עם זאת, שני סוגי הדם נשמרים בנפרד ב אטריה, הדם דל החמצן נכנס לאטריום הימני ומיד זורם לתחתית החדר. הדם העשיר בחמצן שנכנס לאטריום השמאלי נכנס גם לחדר הבודד, אך הוא נשמר על ידי דם דל חמצן, הנמצא בחלקו התחתון של החדר. יש גם חלק מוצק וגם נוזלי מהדם. תאי הדם האדומים והלבנים מועברים בחלק הנוזלי.
ריאות
למרות שהצפרדע מסוגלת לנשום דרך עורו, במיוחד כשהם מתחת למים, יש לחיות האלה שקיות פשוטות שעובדות כמו ריאות. האוויר שהצפרדע שואף דרך שני נחיריו זורם דרך קנה הנשימה של החיה ומגיע אליהם. לעומת זאת, לצפרדעים אין דיאפרגמות או צלעות, אשר במקרה של בני אדם, משמשות לסייע בנשימה. הם נושמים על ידי פתיחת פיהם כדי לאפשר לזרום אוויר דרך צינורות הנשימה, והם מסוגלים לנשום גם על ידי סגירת נחיריהם והורדת תחתית הפה, מה שגורם להרחבת גרונו של החיה. מכיוון שנחיריים של הצפרדע פתוחים האוויר נכנס לפה המוגדל ופשוט נאלץ לריאות על ידי כיווץ שרירי הפה, ולאחריו נחיר הנחיריים שוב.
בֶּטֶן
העיכול מתחיל בפה של הצפרדע, המכיל שיניים קטנות ולא יעילות בלסת העליונה. הפה מכיל גם לשון דביקה שהצפרדע יכולה לבלוט בכדי לתפוס טרף, המועבר דרך הוושט אל הקיבה. המעי הדק, בלוטות העיכול הגדולות, כיס המרה, הלבלב והכבד, יוצרים את שאר מערכת העיכול. הן פסולת נוזלית והן מוצקה עוזבות את הגוף דרך פתח הגלימה.