כיצד לחשב את הנקודה האיזואלקטרית של פפטידים

מְחַבֵּר: Alice Brown
תאריך הבריאה: 26 מאי 2021
תאריך עדכון: 1 יולי 2024
Anonim
מחומצות אמינו לחלבונים - בניית המולקולה וקביעת מטען
וִידֵאוֹ: מחומצות אמינו לחלבונים - בניית המולקולה וקביעת מטען

תוֹכֶן

פפטידים הם שברי פולימרים קצרים המורכבים מחומצות אמינו. לכל פפטיד יש רצף מסוים של חומצות אמינו המסומן בקוד בן שלוש אותיות או אחת בלבד; לדוגמא, חומצת האמינו אלנין מקוצרת כ"עלא "או" A ". עומס הפפטידים בתמיסה תלוי בחומציותו. הנקודה האיזואלקטרית (pI) מתייחסת לערך החומציות של התמיסה שבה למולקולת הפפטיד יש מטען נטו השווה לאפס. המסיסות של הפפטיד היא מינימלית בנקודה האיזואלקטרית. השתמש בשרתי אינטרנט זמינים כדי לחשב את ערך ה- pI עבור רצף חומצות אמינו של פפטיד.

שלב 1

רצף את הפפטיד באמצעות הקוד האותי. לדוגמא, אם לפפטיד יש רצף של חומצות אמינו Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (Alanine - Serine - Glutamic acid - Leucine - Proline), אז רצף האות האחד יהיה "ASELP". במידת הצורך, עיין בטבלת ההמרה של אות אחת לשלוש אותות המוצגת בסעיף משאבים.


שלב 2

השתמש בכל דפדפן, כגון Internet Explorer או Firefox, כדי להזין שרת המחשב את הנקודה האיזואלקטרית של פפטיד (pI); ראה משאבים.

שלב 3

הקלד את רצף האותיות החד של הפפטיד - בדוגמה שלנו, "ASELP" - בתיבה ולחץ על "חישוב".

שלב 4

קרא את הערך של הנקודה האיזואלקטרית (pI) הנתונה בשורה של "pI / Mw תיאורטי" (pl תיאורטי). בדוגמה שלנו, ה- pI הוא 4.00. שימו לב שהשרת מחשב גם את המשקל המולקולרי (Mw) של הפפטיד.