תוֹכֶן
האסקי הסיבירי הם כלבי מזחלות, הידועים בפרוותם ובעיניהם המרשימות. העיניים יכולות לנוע בין גווני כחול וחום לגווני צהוב וכתום. לפעמים לכלב יכולות להיות עיניים בצבע שונה. הסיבה מאחורי המוזרויות הללו היא גנטיקה. לחלק מהצרדויות יש גנים השולטים בצבע עיניהם בנפרד, בעוד שבאחרים צבע העיניים נקבע על ידי אותם גנים השולטים בצביעת כל גופם.
עיניים כחולות
עיניים כחולות בקליפות סיביריות נגרמות על ידי גן דומיננטי שעובר בירושה בנפרד מהגן השולט בצבע המעיל. ניתן למצוא עיניים כחולות בקליפות מכל צבע שיער. גווני הכחול שהאסקי יכול לרשת נעים בין כחול בהיר לכחול שמים. ההשפעות הדרמטיות ביותר של הצבע הכחול נראות יותר אצל כלבים עם מעילים כהים יותר.
עיניים חומות
הגוונים החומים בעיני הקליפות הסיביריות יכולים לנוע בין חום בהיר לכמעט כתום לכמעט שחור. הטון נשלט על ידי "משנים" המשפיעים על הגן הקובע עיניים חומות. משנים גם קובעים הבדלים באורך השיער ובצבע. לפעמים הגן מרל משפיע על צביעת העיניים החומות. גן זה גורם לכלב להיות עם עין כחולה אחת ולעין חומה אחרת. צרוד יכול להיות גם כתמים כחולים בתוך עין חומה, הנקראים עין מפוצלת. בשני המקרים, הצבע הכחול הוא תוצאה של אובדן חלקי של פיגמנטציה חומה הנגרמת על ידי גן המרל.
עיניים צהובות
לחלק מהקליפות הסיביריות יש עיניים צהובות עם גוון כחול או אפור. צבע זה הוא תוצאה של גן תורשתי שמדלל צבעים מסוימים בגוף הכלב. גן זה משפיע על העיניים והשיער. אזורים צבעוניים המכילים בדרך כלל פיגמנטציה שחורה הם בעלי גוון אפור כהה. האזורים שצריכים להכיל פיגמנט אדמדם-צהוב מאבדים את גווניהם האדומים. גן דילול זה שולט בשני הפיגמנטציות. את התוצאה ניתן לראות בקליפות אפורות עם עיניים צהובות.
עיני ענבר
עיניים ענבריות הן תוצאה של הורשת גן המשפיע על הפיגמנטציה של כל הגוף. צרוד סיבירי עם עיניים ענבר יש גן המחליף את הפיגמנט השחור בפיגמנט חום שוקולד או צבע אדמדם המכסה את כל הגוף. ואז, מה שבדרך כלל יהיה עיניים חומות כהות נראה בגוון בהיר של זהב וכתום. כלבים עם עיניים ענבריות יכולים גם הם להיות מושפעים מגן מרל ובעלי צבעים שונים או עיניים מפוצלות.