תוֹכֶן
צבע העין של האדם נקבע על ידי גנטיקה, אבל הגן לא מבטיח מה צבע זה יהיה. הגן OCA2 שולט בדרך כלל בכמות פיגמנט המלנין שגוף מייצר, ומשפיע על 74% משונות הצבע של העין האנושית, אך גם הגן הזה מושפע מגורמים רבים אחרים ב- DNA. רוב העיניים האנושיות יש צבע חום או כחול, אבל צבעים אחרים כמו חום ואפור הם נדיר יותר. בנוסף, אוכלוסיות שונות נוטים להיות בעלי צבעי עיניים שונים שכיחים יותר או נדירים.
ירוק
הצבע הירוק בעיניים הוא הנפוץ ביותר מבין אלה הנדיר, שכן הוא נמצא ברחבי העולם, אבל זה רק על 2% מכלל האוכלוסייה של העולם. צבע זה מיוצר על ידי כמות גדולה של מלנין באייריס במהלך הפיתוח, שהוא תוצאה של גנטיקה. כמו צבעי עיניים נדירים אחרים, עיניים ירוקות בולטות לעתים קרובות במשפחה, שכן שבץ דומיננטי כמו עיניים חומות מתבטא בתדירות גבוהה יותר.
אמבר
עיניים אמבר נקראות לעתים קרובות "עיניים זאב" כי הם דומים פיגמנט של זאבים. עין זו מורכבת פיגמנט צהוב או זהב עם קצת גוון נחושת וחלודה. ליפוקרום, שם הפיגמנט הצהוב, הוא נדיר ביותר וכתוצאה מכך, מעטים אנשים בעלי צבע עיניים זה.
אדום
בדרך כלל עיניים אדומות נמצאות בבני אדם עם בעיה פיגמנט כלשהי, כגון לבקנים. ישנם מקרים נדירים קיימים, בהם אנשים ללא בעיות פיגמנט יש עיניים אדומות. פיגמנט זה עשוי להיות תוצאה של דליפה קטנה של דם על הקשתית, גרימת עין אדמדם.
סגול
ישנם שני מצבים שונים שגורמים לעיניים להיראות סגולות. כאשר אין מספיק פיגמנט איריס לכסות את כלי הדם, האור המשקף את הכלים האלה עושה את העיניים סגול. זה יכול להתרחש גם אם אדם עם עיניים כחולות יש עיניים אדומות בגלל כמה גירוי, מה שהופך אותם להופיע סגול. אם המצב השני הוא המקרה, צבע סגול בעיניים הוא זמני.
שחור
יש אנשים מאמינים כי עיניים שחורות לא קיים, כי צבע הוא רק חום כהה מאוד. אבל היו כמה מקרים שהצביעו על עיניים שחורות טהורות בבני אדם, על פי הספר "אבולוציה של העין".